教學協作單位
南京中醫藥大學
南京中醫藥大學是一所發展中的，以中醫藥為主體的，多學科協調發展的重點大學，隸屬於江蘇省人民政府。該校是全國建校最早的高等中醫藥院校之一。
南京中醫藥大學是世界衛生組織（who）傳統醫學合作中心；國家衛生部確定的國際針灸培訓中心、全國中醫師資進修教育基地、臨床藥理基地、中國中醫文獻檢索中心分中心；國家教育部確定的國家基礎學科理科人才培養與科學研究基地、首批獲准接受和培養留學生及臺灣地區學生的中醫藥高等院校之一；國家人事部、全國博士後管理委員會批准的全國首批3個中醫學博士後科研流動站建站單位之一，具有博士生導師自審權和主要學科專業的教授評審權。
廣州中醫藥大學
廣州中醫藥大學成立於1956年，是全國首批4所中醫藥高等學府之一，也是國內首批具有碩士、博士學位授予權的高校之一；擁有中醫學、中西醫結合、中藥學三個一級學科博士學位授予權，博士後科研流動站3個，博士學位授權學科專業19個、碩士學位授權學科專業42個，博士學位授權點覆蓋了中醫學、中西醫結合以及中藥學三個一級學科項下的所有二級學科，碩士學位授權點覆蓋了中醫學、中西醫結合、中藥學、臨床醫學、護理學和藥學六個一級學科項下的所有二級學科；學校還有中醫藥高校唯一的科學技術哲學專業碩士點。
學校擁有一級學科國家重點學科1個，二級學科國家重點學科5個，是全國中醫藥高校僅有的擁有一級學科國家重點學科中醫學的2所高校之一，也是廣東省內建有一級學科國家重點學科的3所高校之一。學校還擁有一級學科省重點學科2個、二級學科省重點學科1個，國家中醫藥管理局重點學科10個。現有國家中藥現代化化工程技術研究中心（合作）1個，科技部重點實驗室、研究中心、基地3個，教育部現代中成藥工程技術中心1個，省部共建重點實驗室“中藥資源科學”1個，國家藥品臨床研究基地3個。
臨床實習基地
江蘇省中醫院
江蘇省中醫院（南京中醫藥大學附屬醫院、江蘇省紅十字中醫院），創建於1954年10月。醫院是一所現代化綜合性中醫醫院，擁有29個臨床科室，配備包括全身螺旋ct在內的功能先進、配備齊全的大型醫療設備，固定資產近億元。
醫院先後被定為國際針灸培訓中心、世界衛生組織傳統醫學合作中心臨床基地、全國中醫臨床進修基地和衛生部臨床藥理研究基地，1993年被國家中醫藥管理局評定為三級甲等中醫院，1994年被評為全國省級示範中醫院和全國衛生系統先進集體，1997年獲江蘇省、南京市“十佳醫院”、“江蘇省文明單位”等光榮稱號，1999年被評為全國“百佳醫院”。
南京市中醫醫院
南京市中醫醫院建于 1956 年，是南京市唯一的一所市級綜合性中醫醫院，1995年被評為三級甲等中醫醫院，1996年成為南京中醫藥大學第三附屬醫院。
醫院技術力量雄厚，科室設置安全。全院開設專病門診37個，肛腸科1994年6月通過國家中醫藥管理局評審驗收，成為全國首家中醫專科醫療中心。醫院作為附屬醫院及國際針灸培訓中心的教學實習基地，每年接收實習、進修人員110餘人。十年來，同時為三十二個國家和地區培養外國學員230餘人。
常州市中醫醫院
常州市中醫醫院始建於1956年。醫院心腦血管科、骨傷科為省中醫重點臨床專科，其中風濕科、兒科為市級中醫重點專科，並且彙粹了屠揆先、張志堅、程子俊等一批享譽全國、全省的名老中醫。
1987年，常州市中醫醫院成為南京中醫藥大學第三教學醫院。1996年躋身國家三級甲等中醫醫院行列。1997年被評為“江蘇省十佳醫院”，1999年被評為全國衛生系統先進單位。
蘇州市中醫醫院
蘇州市中醫醫院創建于1956年，目前該院擁有一批省、市名中醫、名中西醫結合專家。是全國示範中醫醫院和三級甲等中醫院、南京中醫藥大學附屬醫院、南京中醫藥大學教學醫院。醫院現有職工570名，床位350張，年門診量約45萬人次，設有內、外、骨傷、肛腸、婦、兒、針灸、推拿、康復、皮膚、五官、眼、口腔、急診等科。骨傷科被列為國家中醫重點臨床專科建設單位，消化科被列為省中醫重點臨床專科。
廣東省中醫院珠海醫院
廣東省中醫院珠海醫院，原為珠海市中醫院，建於1987年。1996年，醫院通過評審成為國家三級甲等中醫院，2000年10月成為廣東省示範中醫院，是廣東省中醫藥學會脊柱專業委員會和神經內分泌專業委員會基地、中國中醫藥學會兒科培訓中心、廣東省脊椎病治療中心、珠海市中西醫結合創傷骨科中心，是廣州中醫藥大學、澳門科技大學、澳大利亞悉尼中醫學院等高等醫藥院校學生的教學實習基地。2002年度被珠海市評為“院前急救先進單位”。
中山市中醫院
廣東省中山市中醫院創建於1957年，是一所集醫療、教學、科研、預防保健於一體的綜合性三級甲等中醫醫院、國家示範中醫院、廣東省百家文明醫院、廣州中醫藥大學附屬醫院、廣東省中醫名院、廣東省中醫藥文化養生旅遊示範基地。先後榮獲全國中醫醫院中醫藥文化建設試點單位、全國中醫藥系統創先爭優活動先進單位、全國中醫藥文化先進單位、全國三八先進集體、廣東省文明單位、廣東省中醫藥強省建設先進單位等榮譽稱號。作為廣州中醫藥大學的附屬醫院，現有博士生導師3人、碩士生導師39人，教授51人，副教授29人。
江門市五邑中醫院
江門市五邑中醫院（前身為江門市中醫院）成立於1958年，現已發展成為一所集醫療、科研、教學、預防保健、康復為一體的綜合性中醫醫院，先後成為三級甲等中醫醫院、全國示範中醫院、首批廣東省中醫名院、全國中醫醫院資訊化示範單位、暨南大學附屬江門中醫院。醫院腦病科為江門市首個國家臨床重點專科（中醫專業）；腦病科、傳染病科為國家“十一五”中醫重點專科；婦科為國家“十二五”中醫重點專科建設單位；腦病科、骨傷科、婦科、肛腸科、肺病科為廣東省中醫重點專科；腎病科、心病科、脾胃病科、針灸科為省“十二五”中醫重點專科建設單位。
新會中醫院
新會中醫院創建於1959年3月，是一所具有現代規模的綜合性中醫醫院，也是國家首批確認的“二級甲等中醫醫院”和“國家示範中醫醫院”，同時也是廣東省中醫名院建設單位，廣州中醫藥大學非直屬附屬醫院，是南方醫科大學、香港大學和澳門科技大學臨床教學醫院。骨傷、蛇傷、心腦血管疾病、肛腸病為本地區享有聲譽的特色專科。其中，蛇傷治療科是廣東省蛇傷治療重點專科建設單位；骨傷科和心腦血管專科是江門市重點專科。蛇傷科、骨傷科和肛腸科被評為廣東省中醫特色專科。近年來，新會中醫院獲得國家教育部、省、廳局等各級科技成果30多項。曾獲得“全國衛生系統先進集體”、“廣東省文明中醫醫院”、 “廣東省百家文明醫院”、“廣東省對口支援基層建設先進單位”、“江門市衛生系統糾正行業不正之風先進單位”、“江門市標兵文明單位”等多項殊榮。